システム環境設定でアカウントを選択「ログイン項目」タブを選択するとログイン時に起動されるプログラムの一覧が表示されます。ここに登録するとログイン時自動的に起動されます。ここの登録・削除（まぁ変更も出来ますが）をプログラムから行いたい人はサンプルが developer.apple.com に有るので参考にしてみて下さい。
http://developer.apple.com/samplecode/LoginItemsAE/
AppleEvent を c プログラムから発行して制御しています。